Heebal Kim's Laboratory

Research Award


Two kinds of awards are given to the students with excellent research achievement.
- Research Of The Year : awarded to the student who has published an outstanding research article.
- Performance Of The Year : awarded to the student with the highest cumulative impact factor during the year.

The award is supported by Kukdam scholarship foundation based on the students' academic achievement throughout the year.
The annual award ceremony is held in April.

본 연구실에서는 연간 연구 성과를 바탕으로 학생들에게 두 가지 종류의 상을 수여합니다.
- '최우수 논문 상(Research Of The Year)': 해당년도 가장 높은 Impact Factor의 연구 논문을 발표한 학생에게 수여됨
- '최고 누적 임펙트 상(Performance Of The Year) : 해당년도 논문 실적의 누적 Impact Factor가 가장 높은 학생에게 수여됨

본 수여식은 국담 장학재단의 후원으로 3월을 시작으로 1년간의 연구 성과를 토대로 수여되며 시상식은 4월에 진행됩니다.

Winner Summary
2019 2018
Research
of The Year
Kwondo Kim
Kwondo Kim
Performance
of The Year
Donghyeok Seol
Jisung Jang(1st)
Joon Yoon(2nd)

Winner Detail

2019

Kwondo Kim

  • Ph.D Course

Research Of The Year

PUBLICATION INFO

  • - De novo emergence and potential function of human-specific tandem repeats in brainrelated loci.
    Human Genetics. 138(6) [LINK]

    본 연구는 진화적으로 인간에서 생긴 탄뎀 반복(human-specific TR ㅡ HSTR)을 찾기 위해 전장유전체 수준의 분석을 실시함. 이를 통해 뇌 조직에서 HSTR 관련 유전자의 발현량이 비인간 영장류(NHP)보다 인간에서 유의하게 높다는 사실을 확인하였고, 이는 반복서열의 출현과 단기간에 일어난 인간의 뇌 기능 진화의 연관성을 간접적으로 보여줌.

Donghyeok Seol

  • Ph.D Course

Performance Of The Year

PUBLICATION INFO

  • - Identification of Copy Number Variation in Domestic Chicken Using Whole-Genome Sequencing Reveals Evidence of Selection in the Genome. Animals. 9(10) [LINK]

    본 연구를 통해 Red Jungle Fowl, Cornish, Rhode Island Red 및 White Leghor 닭에 대한 전장유전체 시퀀싱(whole-genome sequencing)을 수행하였고, 상염색체에 위치한 총 663 개의 domesticated-specific CNVR을 발견함. 본 연구는 토종 닭의 유전적 특성을 이해하는데 도움을 주며, 닭의 육종 시스템 개발에 유용한 정보를 제공할 것으로 기대됨.

  • - Accurate and Strict Identification of Probiotic Species Based on Coverage of Whole-metagenome Shotgun Sequencing Data. Frontiers In MicroBiology. 10 [LINK]

    유산균 제품에 포함된 미생물을 식별하는 문제는 제품 품질 관리 및 공중 보건에서 중요한 문제임. 기존의 문제점들을 극복하고 보다 신뢰성 높은 종 식별을 위해 본 연구에서는 coverage-based Whole-metagenome Shotgun 파이프 라인을 설계함. Coverage-based 파이프 라인은 기존의 레이블링 문제를 해결하면서 유산균 제품의 품질 관리에 유용하게 활용될 것으로 기대됨.

2018

Kwondo Kim

  • Ph.D Course

Research Of The Year

PUBLICATION INFO

  • - Deciphering the evolutionary signatures of pinnipeds using novel genome sequences: The first genomes of Phoca largha, Callorhinus ursinus, and Eumetopias jubatus Scientific Reports. 8 [LINK]

    본 연구에서는 site-wise sequence change에 초점을 맞추어 세 기각류 (점박이 물범, 북방물개, 큰바다사자)의 유전체를 시퀀싱하고 해당 종들의 특징을 유전 정보와 비교하여 확인함. 이를 통해 기각류의 진화 연구로 중요하게 생각되는 수륙 양용의 소리 인식 관련 유전자에서 양성선택 신호를 발견함. 본 연구는 향후 수렴 진화 또는 유전자 기능(gene function)관련 연구에 기반지식으로서 활용될 것으로 기대됨.

Jisung Jang

  • Ph.D Candidate

Performance Of The Year
(First Author)

PUBLICATION INFO

  • - Microbial community and functions associated with digestion of algal polysaccharides in the visceral tract of Haliotis discus hannai: Insights from metagenome and metatranscriptome analysis. Plos One. 13(10) [LINK]

    조류의 다당류 소화 메커니즘 및 그 기원을 알아내기 위해, 태평양 전복 종인 H. discus hannai 내장 추출물의 메타 게놈(metagenome) 및 메타 트랜스크립트(metatranscriptome) 분석과 조류 다당류-소화 효소의 코딩 서열에 대한 추가 분석을 수행함. 그 결과, 전복의 내장 추출물에서 알긴산 분해 효소가 내장 박테리아가 아닌 숙주 자체에 의해 생성되었다고 밝힘.

  • - Time-calibrated phylogenomics of the porcine epidemic diarrhea virus: genome-wide insights into the spatio-temporal dynamics. Genes&Genomics. 40(8) [LINK]

    본 연구에서는 PEDV 게놈 배열을 베이시안적 추론 및 최대우도 방법을 사용하여 분석함. 이를 통해 PEDV는 모두 6개 그룹으로 나뉘고 (5개의 유행성 바이러스 및 1개의 고전적인 바이러스 그룹), 3.38 × 10-4 substitution/site/year 의 진화 속도를 가지며, 해당 바이러스가 가장 최근 공통 조상으로부터 75.9년 전 분화되었다고 예측함. 또한 베이지안 스카이라인 플롯 분석을 통해 PEDV가 유효감염의 감소가 발생한 2012년경 단기간만 제외하고 지속적인 규모를 유지했음을 보여줌.

Yoon Joon

  • Ph.D Candidate

Performance Of The Year
(Second Author)

PUBLICATION INFO

  • - Time-calibrated phylogenomics of the porcine epidemic diarrhea virus: genome-wide insights into the spatio-temporal dynamics. Plos One. 40(8) [LINK]

    본 연구에서는 PEDV 게놈 배열을 베이시안적 추론 및 최대우도 방법을 사용하여 분석함. 이를 통해 PEDV는 모두 6개 그룹으로 나뉘고 (5개의 유행성 바이러스 및 1개의 고전적인 바이러스 그룹), 3.38 × 10-4 substitution/site/year 의 진화 속도를 가지며, 해당 바이러스가 가장 최근 공통 조상으로부터 75.9년 전 분화되었다고 예측함. 또한 베이지안 스카이라인 플롯 분석을 통해 PEDV가 유효감염의 감소가 발생한 2012년경 단기간만 제외하고 지속적인 규모를 유지했음을 보여줌.

  • - Multivariate genome-wide association studies on tenderness of Berkshire and Duroc pig breeds. Genes & Genomics 40(7) [LINK]

    본 연구는 버크셔와 듀록 대상으로 / MV-GWAS 분석을 통해 돼지고기의 tenderness와 관련된 후보 유전자와 생물학적 경로의 연관성을 확인하였음. 그 결과 버크셔에서 tenderness 관련 후보 유전자를 확인하고, 버크셔와 듀록에서 공통적으로 tenderness 관련 pathway들을 발견하였음. 이러한 발견들은 돼지고기의 품질을 향상시키기 위한 육종시스템에 있어 도움이 될 것임.

  • - The transcriptome of early chicken embryo reveal signaling pathways governing rapid asymmetric cellularization and lineage segregation. Development. 145(6) [LINK]

    본 연구에서는 산란 전 배아를 대상으로 RNA-seq 분석을 수행하였고 이를 통해 닭의 발달이 2 단계에 거쳐 일어나며 이때 활성화되는 유전자를 발견함. 또한, 닭의 발달의 초기 단계에서 닭 특이적인 유전자 발현과 다른 종들과 유사한 발현을 관찰함. 이러한 발견들을 통해 조류 배아 발생에 대한 게놈을 이해하고 양막 동물들 간의 차이를 확인하였음.

  • -Deciphering signature of selection affecting beef quality traits in Angus cattle. Genes & Genomics. 40(1) [LINK]

    본 연구는 앵거스에서 고기의 품질을 결정하는 형질 및 여러가지 표현형과 관련된 선택된 게놈 영역을 탐구하는 것을 목적으로 함. XP-CLR 통계적 방법을 사용하여 한우 및 저지 품종과 비교하였고 쇠고기의 품질과 관련된 형질, 체격, 번식과 난산, 사료 효율, 털 색, 유전적 질환에 영향을 주는 유전자들이 앵거스에서 양성선택을 받고 있다는 사실을 밝힘. 이러한 발견들은 앵거스와 일반적인 육우의 연구에 유용한 정보를 제공할 것임.